Jako szkoła ćwiczeniowa Uniwersytetu Komisji Edukacji Narodowej w Krakowie (UKEN, dawniej Uniwersytet Pedagogiczny) organizujemy praktyki dla studentów, a nasi nauczyciele uczestniczą w szkoleniach na terenie uczelni. Również nasi uczniowie mają możliwość uczestniczenia w wykładach oraz zajęciach organizowanych przez UKEN.
Nasza młodzież uczestniczy w lekcjach muzealnych, zajęciach, warsztatach oraz grach dydaktycznych organizowanych przez muzeum. Na terenie Parku Lotników co roku odbywa się Bieg im. płk. pil. S. Skarżyńskiego – patrona naszej szkoły. Tradycyjnie w auli budynku muzeum odbywa się uroczyste rozpoczęcie roku szkolnego oraz ślubowanie uczniów klas pierwszych.
Na terenie jednostki co roku odbywa się musztra wojskowa dla naszych uczniów, ponadto młodzież ma możliwość zwiedzenia bazy, zapoznania się z jej historią, funkcjonowaniem oraz zadaniami, jakie realizuje. Podczas wycieczek uczniowie zdobywają wiedzę dotyczącą budowy samolotów, a na spotkaniach z profesjonalistami poznają specyfikę zawodu lotnika czy pracowników obsługi naziemnej. Poczet sztandarowy naszej szkoły uczestniczy w obchodach ważnych dla jednostki świąt i uroczystości.
Współpraca Zespołu Szkół Ogólnokształcących nr 9 z Aeroklubem Krakowskim obejmuje zajęcia i projekty na lotnisku w Pobiedniku Wielkim. Opisane zajęcia klasy lotniczej oraz możliwości szkolenia szybowcowego i spadochronowego dotyczą uczniów XXIII Liceum Ogólnokształcącego.
Uniwersytet Rolniczy w Krakowie i Zespół Szkół Ogólnokształcących nr 9 w Krakowie zawarły porozumienie o współpracy. Celem umowy jest m.in. wzajemne inspirowanie, podejmowanie i realizowanie inicjatyw związanych z promocją nauk rolniczych i przyrodniczych w środowisku lokalnym. W ramach umowy URK będzie uzupełniać i wzbogacać zajęcia dydaktyczne prowadzone przez szkołę o elementy właściwe dla kierunków kształcenia i profilu badawczego Uczelni.
Nauczyciele wychowania fizycznego prowadzą praktyki dla studentów Akademii Kultury Fizycznej im. Bronisława Czecha w Krakowie (AKF, dawniej AWF), uczestniczą w szkoleniach organizowanych przez akademię oraz realizują program unijny „Praktyczne wychowanie fizyczne”.
Nasi uczniowie mają możliwość uczestniczenia w wyjazdach rekreacyjnych oraz zajęciach organizowanych przez Centrum Kultury Calasanz. Biorą udział w Rekolekcjach Wielkopostnych, pikniku parafialnym oraz innych wydarzeniach organizowanych na terenie parafii. Chętnie spędzają swój wolny czas w świetlicy ojców pijarów oraz trenują w sekcjach Parafialnego Klubu Sportowego „PORTA” piłkę nożną, siatkową lub tenis stołowy.